RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SNX32Q86XE0 403 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ANKFN1Q8N957 763 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PCDH19Q8TAB3 1148 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ATP2A3Q93084 1043 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CSRNP1Q96S65 589 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CDRT15Q96T59 188 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CALN1Q9BXU9 219 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 VPS33BQ9H267 617 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TMEM165Q9HC07 324 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB26Q9HCK0 441 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PCSK1NQ9UHG2 260 aa10.13□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TRIM38O00635 465 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MDM4O15151 490 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 KRT34O76011 436 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 APRTP07741 180 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PGAM1P18669 254 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GPD1P21695 349 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MPP3Q13368 585 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 STILQ15468 1287 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZPBP2Q6X784 338 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 BORCS5Q969J3 196 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 NUF2Q9BZD4 464 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GRID2O43424 1007 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PSAPP07602 524 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PDGFRBP09619 1106 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MLH1P40692 756 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PRKCEQ02156 737 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DCDC5Q6ZRR9 648 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TBCBQ99426 244 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 KLHL41O60662 606 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SUPT3HO75486 399 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HMGCRP04035 888 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PRKAA2P54646 552 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GRTP1Q5TC63 336 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PACRGLQ8N7B6 248 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D15Q8TC07 691 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 JDP2Q8WYK2 163 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RCN3Q96D15 328 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 WDR41Q9HAD4 459 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PSAT1Q9Y617 370 aa10.12□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CCDC162PA2VCL2 907 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 FUOMA2VDF0 154 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TCAF2A6NFQ2 919 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SULT1C4O75897 302 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HOXC6P09630 235 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HMOX2P30519 316 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PSMD7P51665 324 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RAB6CQ53S08 254 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 IL23RQ5VWK5 629 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TERB1Q8NA31 727 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RDH11Q8TC12 318 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TFAP2CQ92754 450 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 CPNE1Q99829 537 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DRC3Q9H069 523 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RAB6CQ9H0N0 254 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 SLC17A6Q9P2U8 582 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 FBXO40Q9UH90 709 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 ARHGEF37A1IGU5 675 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DLGAP1O14490 977 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 DGKIO75912 1065 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 BAIAP3O94812 1187 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 VAPBO95292 243 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MPOP05164 745 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 COL6A2P12110 1019 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 MYF6P23409 242 aa10.11□□□□□ -0.79
HCG18-242ENST00000602319 GPD2P43304 727 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 184.6 ms