RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 STAP1Q9ULZ2 295 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ERVW-1Q9UQF0 538 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 PCNX2A6NKB5 2137 aa27.56■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 GABRB2P47870 512 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ECT2LQ008S8 904 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SLC14A1Q13336 389 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 CDKAL1Q5VV42 579 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 USP30Q70CQ3 517 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 C18orf8Q96DM3 657 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SGK2Q9HBY8 427 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 TAB2Q9NYJ8 693 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 COX16Q9P0S2 106 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ITIH6Q6UXX5 1313 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 NUMA1Q14980 2115 aa27.55■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 F8VZ95 297 aa27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 MAOBP27338 520 aa27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 FAM124AQ86V42 546 aa27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 CEP295Q9C0D2 2601 aa27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 FSCN3Q9NQT6 498 aa27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa27.54■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 M0QYT0 321 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 GIPC1O14908 333 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 F9P00740 461 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 NNMTP40261 264 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 PLK1P53350 603 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 NME3Q13232 169 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 BRMS1LQ5PSV4 323 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 FKBP15Q5T1M5 1219 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 FBXL22Q6P050 247 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 PIP4P1Q86T03 277 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ERICH1Q86X53 443 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ZNF677Q86XU0 584 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 DEFB124Q8NES8 71 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 GPT2Q8TD30 523 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 NPY6RQ99463 290 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa27.53■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SIN3BO75182 1162 aa27.52■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 SEMA4FO95754 770 aa27.52■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ACSL1P33121 698 aa27.52■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 GRIK2Q13002 908 aa27.52■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 AUHQ13825 339 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa27.52■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 ANO10Q9NW15 660 aa27.52■■■□□ 2
ODC1-204ENST00000446285 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 VASPP50552 380 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 KRT31Q15323 416 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 C5orf22Q49AR2 442 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 C9orf64Q5T6V5 341 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 IL27RAQ6UWB1 636 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 APCDD1Q8J025 514 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 NT5C3BQ969T7 300 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 VPS16Q9H269 839 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 OSGEPQ9NPF4 335 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 HS3ST4Q9Y661 456 aa27.51■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 CLDN11O75508 207 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 PDGFRAP16234 1089 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 CXCR3P49682 368 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 TAF3Q5VWG9 929 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 XYLT1Q86Y38 959 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 EPS8L1Q8TE68 723 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 GANQ9H2C0 597 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 WDCPQ9H6R7 721 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 VANGL2Q9ULK5 521 aa27.5■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 PAGE1O75459 146 aa27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 GJB3O75712 270 aa27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 SULT1E1P49888 294 aa27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 CST6Q15828 149 aa27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 SLC25A52Q3SY17 297 aa27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
ODC1-204ENST00000446285 LRSAM1Q6UWE0 723 aa27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms