RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384561.1

RNU6-30P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 30, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-30P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-30P-201ENST00000384561 A0A096LPK6 155 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 TLDC2A0PJX2 215 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SERTM1A2A2V5 107 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 A6NCN8 305 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 B9A039 149 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 I3L1I5 382 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 EYA2O00167 538 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 PIK3CDO00329 1044 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SOCS6O14544 535 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 LDLRAD4O15165 306 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 GNPATO15228 680 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SART1O43290 800 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 TSPAN3O60637 253 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 HCN1O60741 890 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ALOX12BO75342 701 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 CDC45O75419 566 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 FOXH1O75593 365 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SEC14L2O76054 403 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 TSPAN13O95857 204 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 AHSGP02765 367 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 PRH1P02810 166 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 TFF1P04155 84 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 LIPFP07098 398 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SPARCP09486 303 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 IGHV4-31P0DP07 118 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 CYP2C8P10632 490 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 CKMT1AP12532 417 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 DEFA4P12838 97 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 AMY2BP19961 511 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 AGAP20933 346 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ZP3P21754 424 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ITPKAP23677 461 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ABCD3P28288 659 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 TEAD1P28347 426 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 KIR2DL3P43628 341 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 STK19P49842 368 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 GTF2A2P52657 109 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 KCNK10P57789 538 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 VLDLRP98155 873 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SPIBQ01892 262 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 CHRNEQ04844 493 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 FUT2Q10981 343 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 FAPQ12884 760 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 USP4Q13107 963 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 GAB1Q13480 694 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 DAG1Q14118 895 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 GRM4Q14833 912 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 MTF1Q14872 753 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 POU4F3Q15319 338 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 C9orf66Q5T8R8 295 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 LYSMD4Q5XG99 296 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 PMS2CLQ68D20 193 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 C16orf46Q6P387 395 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 Q6ZVH6 145 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 LPCAT2Q7L5N7 544 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 NLRP9Q7RTR0 991 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 FBXO11Q86XK2 927 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ANGPTL5Q86XS5 388 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 WWC1Q8IX03 1113 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ADGRF2Q8IZF7 708 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 LYG1Q8N1E2 194 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 PHTF2Q8N3S3 785 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 TMEM151AQ8N4L1 468 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ZDHHC22Q8N966 263 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 FAM156AQ8NDB6 213 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 C17orf47Q8NEP4 570 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 DBF4BQ8NFT6 615 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 DENND1AQ8TEH3 1009 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SLC20A1Q8WUM9 679 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 OVCA2Q8WZ82 227 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 RILPL2Q969X0 211 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SLC25A28Q96A46 364 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SDCCAG3Q96C92 435 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 R3HDM4Q96D70 268 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SUSD3Q96L08 255 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 TOX2Q96NM4 488 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 ACAP3Q96P50 834 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 DEPDC7Q96QD5 511 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 OSMRQ99650 979 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 LITAFQ99732 161 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SLC6A7Q99884 636 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 FAM110AQ9BQ89 295 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 NRIP2Q9BQI9 281 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SLC30A2Q9BRI3 323 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 PDCD2LQ9BRP1 358 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 MSTO1Q9BUK6 570 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-30P-201ENST00000384561 SELENOOQ9BVL4 669 aa-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms