RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542313.2

ULK1-206, Transcript of unc-51 like autophagy activating kinase 1, human

TSL 3

Gene ULK1, Length 307 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ULK1-206	ENST00000542313	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CLCN1	P35523	988 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MTA1	Q13330	715 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SLC12A1	Q13621	1099 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ARID5B	Q14865	1188 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	VWA3B	Q502W6	1294 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	FSCB	Q5H9T9	825 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CHSY1	Q86X52	802 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CACUL1	Q86Y37	369 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	DEFB106A	Q8N104	65 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	RNF34	Q969K3	372 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CPXM1	Q96SM3	734 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SGK2	Q9HBY8	427 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	DACH1	Q9UI36	760 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		12.5	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	EML5	Q05BV3	1969 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313		F5H5T6	163 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SH3BP5	O60239	455 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	HSF2BP	O75031	334 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CCR1	P32246	355 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	OXCT1	P55809	520 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ECT2L	Q008S8	904 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	GRIK2	Q13002	908 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	USP30	Q70CQ3	517 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MTG2	Q9H4K7	406 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	DDIT4	Q9NX09	232 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CEP83	Q9Y592	693 aa		12.49	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ACACB	O00763	2458 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	TRIM16	O95361	564 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SEMA4F	O95754	770 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	PROS1	P07225	676 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	NNMT	P40261	264 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	PLK1	P53350	603 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SLC6A3	Q01959	620 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MIIP	Q5JXC2	388 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	PASD1	Q8IV76	773 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	APCDD1	Q8J025	514 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	GANC	Q8TET4	914 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	GAREM1	Q9H706	876 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	RRN3	Q9NYV6	651 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	THADA	Q6YHU6	1953 aa		12.48	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MYH10	P35580	1976 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	SIN3B	O75182	1162 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	GRAP2	O75791	330 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	KRT37	O76014	449 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	FSBP	O95073	299 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ERBB2	P04626	1255 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	ZNF883	P0CG24	379 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CD27	P26842	260 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	NOS2	P35228	1153 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	MATK	P42679	507 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ULK1-206	ENST00000542313	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41

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