RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf216Q8TAB5 229 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTG2Q9H4K7 406 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa27.12■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BECN2A8MW95 431 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0Y626 953 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM16O95361 564 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA4FO95754 770 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAP1GAP2Q684P5 730 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL27RAQ6UWB1 636 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHSY1Q86X52 802 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO19Q96H55 970 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTN2A3PQ96KV6 586 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TJP2Q9UDY2 1190 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUMA1Q14980 2115 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOCS3O95396 460 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CER1O95813 267 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV3-25P01717 112 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TACR2P21452 398 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MATKP42679 507 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APBA1Q02410 837 aa27.1■■□□□ 1.93
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITRM1Q5JRX3 1037 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM1BQ8NB78 822 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRGPRX3Q96LB0 322 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAREM1Q9H706 876 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGK2Q9HBY8 427 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGF2RP11717 2491 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIN3BO75182 1162 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BNC1Q01954 994 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF5Q15542 800 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF423Q2M1K9 1284 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRF2BP1Q8IU81 584 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHC3Q92529 594 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GATA6Q92908 595 aa27.09■■□□□ 1.93
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCML1Q9UN30 329 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVW-1Q9UQF0 538 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHD6Q8TD26 2715 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GVT2 93 aa27.08■■□□□ 1.93
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF883P0CG24 379 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-BQ31612 363 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDTC1Q8N5D0 677 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLKLQ8NB16 471 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GANCQ8TET4 914 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BIRC7Q96CA5 298 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM204AQ9H8W3 233 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLK13Q9UKR3 277 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP83Q9Y592 693 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM8BA6NDV4 472 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNU1A8MYU2 1149 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F5H5T6 163 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSBPO95073 299 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLI1P08151 1106 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PON1P27169 355 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK17Q00537 523 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARID5BQ14865 1188 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEAD4Q15561 434 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP30Q70CQ3 517 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PASD1Q8IV76 773 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPXM1Q96SM3 734 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM9SF3Q9HD45 589 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSGEPQ9NPF4 335 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM7SF3Q9NS93 570 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHGC3Q9UN70 934 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSRB2Q9Y3D2 182 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASPMQ8IZT6 3477 aa27.06■■□□□ 1.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC2A3P11169 496 aa27.06■■□□□ 1.92
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