RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 SERHLQ9NQF3 203 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RPTORQ8N122 1335 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PRKCIP41743 596 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PKNOX1P55347 436 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ACTR2P61160 394 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DGKDQ16760 1214 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PANX3Q96QZ0 392 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MTRRQ9UBK8 725 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PSME2Q9UL46 239 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AGLP35573 1532 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 I3L521 148 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AURKAO14965 403 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 USP12O75317 370 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CDK4P11802 303 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RHAGQ02094 409 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 POTEGQ6S5H5 508 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KCNQ3O43525 872 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ANTXR2P58335 489 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MIIPQ5JXC2 388 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TAGAPQ8N103 731 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GATA6Q92908 595 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NXNL1Q96CM4 212 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 B3GALNT1O75752 331 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP8P85298 464 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RAD51Q06609 339 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CDO1Q16878 200 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EXT2Q93063 718 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AMNQ9BXJ7 453 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PHF11Q9UIL8 331 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 POLIQ9UNA4 740 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 POMPQ9Y244 141 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TTC3P53804 2025 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC154A6NI56 674 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MAGEB2O15479 319 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CFBP00751 764 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF410Q86VK4 478 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RFX4Q33E94 735 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 STK32CQ86UX6 486 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 EMC1Q8N766 993 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NR5A2O00482 541 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SSNA1O43805 119 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PDK1Q15118 436 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HPS6Q86YV9 775 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AFG1LQ8WV93 481 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SNX19Q92543 992 aa6.59□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RNF145Q96MT1 663 aa6.59□□□□□ -1.35
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