RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BBS9Q3SYG4 887 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASIP1Q5U651 963 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPGS2Q68CL5 300 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDRPQ86YL5 185 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF276Q8N554 614 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DOCK4Q8N1I0 1966 aa22.49■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERICH4A6NGS2 130 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1QTNF8P60827 252 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASA2Q15283 850 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LZTR1Q8N653 840 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NETO2Q8NC67 525 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC39Q96DD0 335 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPG21Q9NZD8 308 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HS3ST4Q9Y661 456 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGLV3-27P01718 113 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LBX1P52954 281 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFEMP1Q12805 493 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARP6Q2NL67 630 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF567Q8N184 647 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPAG6O75602 509 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOEP02649 317 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELK3P41970 407 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMP13P45452 471 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RING1Q06587 406 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF534Q76KX8 674 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GIPC2Q8TF65 315 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPF3Q92784 378 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VAT1Q99536 393 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL23AQ9NPF7 189 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FNIP2Q9P278 1114 aa22.47■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WASH4PA8MWX3 477 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E9PAM4 449 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2CD2LO14523 706 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN3P26045 913 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COG7P83436 770 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTA1Q13330 715 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PALM2Q8IXS6 379 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR65Q8IYL9 337 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.46■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MLNP12872 115 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCAP28676 217 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRAK1P51617 712 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSGA13Q96PP4 275 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.45■■□□□ 1.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBX18O95935 607 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACRP10323 421 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSTR1P30872 391 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPM1AP35813 382 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBP50607 506 aa22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms