RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	TRPV3	Q8NET8	790 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	EHD4	Q9H223	541 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	HLA-DQA2	P01906	255 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	BATF3	Q9NR55	127 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	IRGM	A1A4Y4	181 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TMCC2	O75069	709 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	CYP11B1	P15538	503 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	WEE1	P30291	646 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	CASR	P41180	1078 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TRIM32	Q13049	653 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	XKR4	Q5GH76	650 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	SHD	Q96IW2	340 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ABCC3	O15438	1527 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	PDHX	O00330	501 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	AIM2	O14862	343 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	DNTT	P04053	509 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	RPIA	P49247	311 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	RAD23B	P54727	409 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28	8e-7	■■□□□ 12
CHD2-208	ENST00000626874	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	LIN54	Q6MZP7	749 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	CCDC103	Q8IW40	242 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TEX46	H3BTG2	121 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	MAGEA4	P43358	317 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	MAGEA9	P43362	315 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	BCAP31	P51572	246 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	MFSD10	Q14728	455 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TEX33	O43247	280 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ABL2	P42684	1182 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	CDH17	Q12864	832 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	NR6A1	Q15406	480 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	GRIK4	Q16099	956 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ARMC3	Q5W041	872 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TMC8	Q8IU68	726 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	IL17RA	Q96F46	866 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	SYT15	Q9BQS2	421 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ACOT9	Q9Y305	439 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	NRCAM	Q92823	1304 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	GSAP	A4D1B5	854 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	CYB5A	P00167	134 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	ITGA2	P17301	1181 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	TYMP	P19971	482 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28	5e-6	■■□□□ 13.5
CHD2-208	ENST00000626874	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CHD2-208	ENST00000626874	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		7.05	□□□□□ -1.28

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