RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 FAM163BP0C2L3 166 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CREB1P16220 341 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 YY1P25490 414 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 KLRK1P26718 216 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CCT8P50990 548 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 POLE2P56282 527 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 KCNJ12Q14500 433 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 GRM4Q14833 912 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.68□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 NRSN1Q8IZ57 195 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 UROC1Q96N76 676 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 AMFRQ9UKV5 643 aa5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.68□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PNPLA6Q8IY17 1366 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CD109Q6YHK3 1445 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 QSOX1O00391 747 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CES2O00748 559 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 FCHO1O14526 889 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS11DO60235 418 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 BAG4O95429 457 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 FGAP02671 866 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 ADRA1DP25100 572 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 PNLIPRP1P54315 467 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 PSG6Q00889 435 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 DEUP1Q05D60 604 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 TTC30AQ86WT1 665 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CERS3Q8IU89 383 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 EFCAB6Q5THR3 1501 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PPLO60437 1756 aa5.67□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 QRICH2Q9H0J4 1663 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PROP1O75360 226 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 GYS1P13807 737 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 DRD1P21728 446 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 DIO1P49895 249 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 DMTNQ08495 405 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 FOXF2Q12947 444 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CSHL1Q14406 222 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 TRIM60Q495X7 471 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 KLHL17Q6TDP4 642 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.66□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.66□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 TBC1D5Q92609 795 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 GCC1Q96CN9 775 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 TIMP4Q99727 224 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 RTKNQ9BST9 563 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.66□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.66□□□□□ -1.5
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