RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523985.5

CCNC-217, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCNC, Length 958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-217ENST00000523985 AIF1P55008 147 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 SEC13P55735 322 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 ENPP2Q13822 863 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 ARID5BQ14865 1188 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 LRRC31Q6UY01 552 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 CHSY1Q86X52 802 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 VSTM4Q8IW00 320 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 MFN1Q8IWA4 741 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 LGI2Q8N0V4 545 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 ALLCQ8N6M5 410 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 RNF214Q8ND24 703 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 BHMTQ93088 406 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 TBCBQ99426 244 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 GABRG3Q99928 467 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 ISCUQ9H1K1 167 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 PIGVQ9NUD9 493 aa14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CCNC-217ENST00000523985 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 A0A1B0GVM2 712 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 PAGE1O75459 146 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 ASLP04424 464 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 HLA-FP30511 346 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CASP14P31944 242 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 SULT2A1Q06520 285 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 MESP2Q0VG99 397 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CDH18Q13634 790 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CCDC14Q49A88 953 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 C2CD6Q53TS8 623 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 EMC10Q5UCC4 262 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 HGSNATQ68CP4 663 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 WDR59Q6PJI9 974 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CHST9Q7L1S5 443 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 RASSF3Q86WH2 238 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CHPFQ8IZ52 775 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CNPY3Q9BT09 278 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 COX16Q9P0S2 106 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 GGA2Q9UJY4 613 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 SCINQ9Y6U3 715 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 COL4A3Q01955 1670 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.95□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 DRGXA6NNA5 263 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 H0Y626 953 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.025e-15■■□□□ 12.3
CCNC-217ENST00000523985 TRIM24O15164 1050 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 AXIN1O15169 862 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 GPD1P21695 349 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 ADRA1BP35368 520 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 PLK1P53350 603 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CDH4P55283 916 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 STARD3Q14849 445 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 ACAP1Q15027 740 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 GEN1Q17RS7 908 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 FBXL22Q6P050 247 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 TSSK4Q6SA08 328 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 NTAN1Q96AB6 310 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 TTC17Q96AE7 1141 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 P2RY11Q96G91 374 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 DNAJC7Q99615 494 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 EPC1Q9H2F5 836 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.94□□□□□ -0.02
CCNC-217ENST00000523985 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms