RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OPHN1O60890 802 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV3-27P01718 113 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACADMP11310 421 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNSP15586 552 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC11A2P49281 568 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPMTP51580 245 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COPAP53621 1224 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHG6Q3KR16 790 aa27.26■■□□□ 1.95
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHST9Q7L1S5 443 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MINDY1Q8N5J2 469 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KREMEN1Q96MU8 473 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR174Q9BXC1 333 aa27.26■■□□□ 1.95
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G4CQ9UP65 541 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CKAP5Q14008 2032 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEI4A8MW99 385 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBX4P57082 545 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RING1Q06587 406 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIP4P1Q86T03 277 aa27.25■■□□□ 1.95
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CADM4Q8NFZ8 388 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGA2Q9UJY4 613 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSL4O60488 711 aa27.24■■□□□ 1.95
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT5P13647 590 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-EP13747 358 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAOBP27338 520 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGSHP51688 502 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPP7Q5T2T1 576 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3R6Q5UE93 754 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFWD3Q6PCD5 774 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACUL1Q86Y37 369 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHI1Q8N157 1196 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2I1PQ8NGU4 316 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2T3Q8NH03 318 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTN6Q9UQ52 1028 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRAK2O43187 625 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBL1XO60907 577 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV3-19P01714 112 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADIPOR2Q86V24 386 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCUBE3Q8IX30 993 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNASE2BQ8WZ79 361 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AZIN2Q96A70 460 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP58Q9BVL2 599 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM245Q9H330 911 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST7Q9NRC1 585 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRYQ5TBA9 3013 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SART1O43290 800 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC6A4P31645 630 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPD2P43304 727 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBLAC2Q68D91 279 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB11Q96P15 392 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WASF3Q9UPY6 502 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FYNP06241 537 aa27.21■■□□□ 1.95
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACADSBP45954 432 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL34P49207 117 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DENND1BQ6P3S1 775 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF366Q8N895 744 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WFDC5Q8TCV5 224 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM149B1Q96BN6 582 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STIM2Q9P246 746 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GTW7 788 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL12A8MUP2 240 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED7O43513 233 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLDP09622 509 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPINK2P20155 84 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD70P32970 193 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRNQ16849 979 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF12L1Q5VU92 463 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM124AQ86V42 546 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LHX5Q9H2C1 402 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLR6Q9Y2C9 796 aa27.2■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNA1EQ15878 2313 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
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