RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-216ENST00000566353 SIPA1Q96FS4 1042 aa22.02■■□□□ 1.12
STX4-216ENST00000566353 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.02■■□□□ 1.12
STX4-216ENST00000566353 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.02■■□□□ 1.12
STX4-216ENST00000566353 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
STX4-216ENST00000566353 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
STX4-216ENST00000566353 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.02■■□□□ 1.12
STX4-216ENST00000566353 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.02■■□□□ 1.12
STX4-216ENST00000566353 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 OXTRP30559 389 aa22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 PDE4CQ08493 712 aa22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 TMEM215Q68D42 235 aa22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 CACUL1Q86Y37 369 aa22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 NAXDQ8IW45 347 aa22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 IGLV3-19P01714 112 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 EPHX1P07099 455 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 ARID5AQ03989 594 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 CUL2Q13617 745 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 MPPE1Q53F39 396 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 SGO2Q562F6 1265 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 LRRC4Q9HBW1 653 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 HESX1Q9UBX0 185 aa22■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 ACADMP11310 421 aa21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 ADIGQ0VDE8 80 aa21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 RNF139Q8WU17 664 aa21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.99■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 METTL12A8MUP2 240 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 TIMM44O43615 452 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 TSPAN3O60637 253 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 CD19P15391 556 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 PNOCQ13519 176 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 EDEM1Q92611 657 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 NUP58Q9BVL2 599 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 RMND1Q9NWS8 449 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.98■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 E7ENQ6 273 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 HLA-EP13747 358 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 HLA-FP30511 346 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 PRCPP42785 496 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 ZNF445P59923 1031 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 OR2T3Q8NH03 318 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 UBA3Q8TBC4 463 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 TSG101Q99816 390 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.97■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 O00370 1275 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 LATS1O95835 1130 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 SETSIPP0DME0 302 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 VDRP11473 427 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 FAM124AQ86V42 546 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 UBR7Q8N806 425 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 LHX5Q9H2C1 402 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 TMEM245Q9H330 911 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 IL21RQ9HBE5 538 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
STX4-216ENST00000566353 CER1O95813 267 aa21.95■■□□□ 1.1
STX4-216ENST00000566353 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
STX4-216ENST00000566353 BNC1Q01954 994 aa21.95■■□□□ 1.1
STX4-216ENST00000566353 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.95■■□□□ 1.1
STX4-216ENST00000566353 ADGRF1Q5T601 910 aa21.95■■□□□ 1.1
STX4-216ENST00000566353 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
STX4-216ENST00000566353 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.95■■□□□ 1.1
STX4-216ENST00000566353 CHST9Q7L1S5 443 aa21.95■■□□□ 1.1
STX4-216ENST00000566353 SCML4Q8N228 414 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms