RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 CBX6O95503 412 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 BPNT1O95861 308 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CTSHP09668 335 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CTAGE8P0CG41 777 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 VSIG10L2P0DP72 767 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CEACAM1P13688 526 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 VAMP1P23763 118 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 MC4RP32245 332 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CLCN5P51795 746 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 PGGT1BP53609 377 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ADPRHP54922 357 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 UCNP55089 124 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CXADRP78310 365 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 PHC1P78364 1004 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 KRT17Q04695 432 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF91Q05481 1191 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 NOGQ13253 232 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 STILQ15468 1287 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 FAM189A2Q15884 450 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 MAN2A1Q16706 1144 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 DGKDQ16760 1214 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 SPECC1Q5M775 1068 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 C9orf57Q5W0N0 161 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 KANK2Q63ZY3 851 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ICE2Q659A1 982 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 BTNL9Q6UXG8 535 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 KRT26Q7Z3Y9 468 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 RNF180Q86T96 592 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CHSY1Q86X52 802 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 THNSL2Q86YJ6 484 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 HIPK1Q86Z02 1210 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CTAGE4Q8IX94 777 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 MDM1Q8TC05 714 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 NEK9Q8TD19 979 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ELP5Q8TE02 316 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 TAS1R2Q8TE23 839 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 RFT1Q96AA3 541 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 WNK4Q96J92 1243 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ZFYVE19Q96K21 471 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 NLRP4Q96MN2 994 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 B9D2Q9BPU9 175 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 EDEM2Q9BV94 578 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CDK19Q9BWU1 502 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 TM6SF1Q9BZW5 370 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 MMP27Q9H306 513 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 VRTNQ9H8Y1 702 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 GALNT9Q9HCQ5 603 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 GOPCQ9HD26 462 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 INCENPQ9NQS7 918 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CNNM1Q9NRU3 951 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM184CQ9NVA4 438 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 EDARQ9UNE0 448 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 EFR3BQ9Y2G0 817 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 VWA7Q9Y334 891 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ACTL7AQ9Y615 435 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 PRSS21Q9Y6M0 314 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 R4GN57 208 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 HCFC1P51610 2035 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 LTN1O94822 1766 aa-0.37□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ACEP12821 1306 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ADCY10Q96PN6 1610 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 GON4LQ3T8J9 2241 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 UNC13CQ8NB66 2214 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 A0A1W2PPI3 338 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 C2CD4DB7Z1M9 353 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 VPS4BO75351 444 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 LY86O95711 162 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 IGKV3-15P01624 115 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 JUNP05412 331 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CHRM2P08172 466 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 ITGA4P13612 1032 aa-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
SNORD57-201ENST00000448188 CD247P20963 164 aa-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms