RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 GJB5O95377 273 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 RASIP1Q5U651 963 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 VPS52Q8N1B4 723 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.73■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 SLC38A8A6NNN8 435 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 SYN1P17600 705 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 RBL1P28749 1068 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 RPL22P35268 128 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 DPYSQ14117 519 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM240Q5SV17 173 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 CFAP58Q5T655 872 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 RFX8Q6ZV50 586 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 IQCKQ8N0W5 287 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 CCHCR1Q8TD31 782 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 USP29Q9HBJ7 922 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 AAASQ9NRG9 546 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 DTLQ9NZJ0 730 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 MFSD11O43934 449 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 CCDC25Q86WR0 208 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 FAM129AQ9BZQ8 928 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 NUP205Q92621 2012 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 TBX18O95935 607 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 URODP06132 367 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 LINC00271P0C7V0 271 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 RARGP13631 454 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 TPI1P60174 286 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 CBX1P83916 185 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 ARHGAP18Q8N392 663 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF461Q8TAF7 563 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 OR12D3Q9UGF7 316 aa19.71■□□□□ 0.75
HOXD10-201ENST00000249501 DCLK1O15075 740 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 KCNN4O15554 427 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 ABLIM3O94929 683 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 SYF2O95926 243 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 ERCC2P18074 760 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 OAS2P29728 719 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 PMS2P54278 862 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 ALS2CLQ60I27 953 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 MSANTD2Q6P1R3 559 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 FIBCD1Q8N539 461 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 BBOF1Q8ND07 529 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 ZBED2Q9BTP6 218 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 PLAAQ9Y263 795 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 STIP1P31948 543 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 CCR1P32246 355 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 NR2C2P49116 596 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 TUFMP49411 452 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 CAV1Q03135 178 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 EFEMP1Q12805 493 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 BRMS1LQ5PSV4 323 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 TP53INP2Q8IXH6 220 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 SERPINB11Q96P15 392 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 SIK2Q9H0K1 926 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 CYP4F11Q9HBI6 524 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 PRDM10Q9NQV6 1147 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 NR2E3Q9Y5X4 410 aa19.7■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 FGF18O76093 207 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 LRIG2O94898 1065 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 GPS2Q13227 327 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 OR2W6PQ8NHA6 318 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 EPB41L4BQ9H329 900 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 SEMA4AQ9H3S1 761 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 COMMD8Q9NX08 183 aa19.69■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 PAGE1O75459 146 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 PPM1AP35813 382 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 OLFM3Q96PB7 478 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 EPAS1Q99814 870 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 TTLL2Q9BWV7 592 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 OSBPL2Q9H1P3 480 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 CLIC5Q9NZA1 410 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 SRGAP2BP0DMP2 458 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 HCAR3P49019 387 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 XRCC4Q13426 336 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 PPP2R5DQ14738 602 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 SLC45A4Q5BKX6 768 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXD10-201ENST00000249501 TPGS2Q68CL5 300 aa19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms