RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428585.5

CARF-208, Transcript of calcium responsive transcription factor, human

TSL 2 BASIC

Gene CARF, Length 2,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARF-208	ENST00000428585	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SNAP23	O00161	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ARNTL	O00327	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SLC16A6	O15403	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	NEMF	O60524	1076 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SOCS5	O75159	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CDKL5	O76039	1030 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TUBB4A	P04350	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CHGB	P05060	677 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ASGR1	P07306	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	KIT	P10721	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	LCP1	P13796	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	FGFR4	P22455	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DUSP4	Q13115	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	COG2	Q14746	738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SEC23A	Q15436	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CEP68	Q76N32	757 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585		A0A1B0GUA9	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RNF223	E7ERA6	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	GRM8	O00222	908 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CHUK	O15111	745 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SPINT1	O43278	529 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	STRN	O43815	780 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PDE6A	P16499	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	GAP43	P17677	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	GRK3	P35626	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DSC2	Q02487	901 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	STK4	Q13043	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	COASY	Q13057	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	POU4F3	Q15319	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CARF-208	ENST00000428585	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms