RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 B4GALT5O43286 388 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 ILDR2Q71H61 639 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 O00370 1275 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNE2O96020 404 aa21.3■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 TBX4P57082 545 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 TMC7Q7Z402 723 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX31Q8N9S9 440 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 IL1RL2Q9HB29 575 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 RIC8BQ9NVN3 520 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SCNN1BP51168 640 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SCNN1GP51170 649 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 CORO7P57737 925 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 POTEAQ6S8J7 498 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 WNK4Q96J92 1243 aa21.3■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 IFT172Q9UG01 1749 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.3■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 KDELR1P24390 212 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.3■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L7P0C7H9 530 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 CNTFP26441 200 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 COPAP53621 1224 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIP10Q15642 601 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 WSCD1Q658N2 575 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR142Q7Z601 462 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 COG4Q9H9E3 785 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 CASZ1Q86V15 1759 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 TRPC5OSA6NMA1 111 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 AKAP10O43572 662 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 RBL1P28749 1068 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 UNC93AQ86WB7 457 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 HOXC6P09630 235 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 12e-8■■□□□ 14.4
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PTPRJ-208ENST00000615445 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 NR2C2P49116 596 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.28■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 CDH17Q12864 832 aa21.28■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 HAO1Q9UJM8 370 aa21.28■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 CPA3P15088 417 aa21.28■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 TUBGCP3Q96CW5 907 aa21.28■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.28■■□□□ 1
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PTPRJ-208ENST00000615445 PFDN1O60925 122 aa21.28■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINB11Q96P15 392 aa21.28■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 GPAMQ9HCL2 828 aa21.28■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.28■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 PEAK1Q9H792 1746 aa21.28■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 CCND1P24385 295 aa21.27■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 YWHAQP27348 245 aa21.27■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 AQP5P55064 265 aa21.27■■□□□ 1
PTPRJ-208ENST00000615445 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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