RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 MAVSQ7Z434 540 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 SMC5Q8IY18 1101 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 IZUMO1Q8IYV9 350 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 FBXL20Q96IG2 436 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MAP7D2Q96T17 732 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ALG8Q9BVK2 526 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 VPS51Q9UID3 782 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 DEPDC5O75140 1603 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 CLTCL1P53675 1640 aa5.81□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MYOM2P54296 1465 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 A1L4Q6 167 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHD1A6NEE1 506 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 AGPSO00116 658 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 C1RP00736 705 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MST1P26927 711 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 EPHA3P29320 983 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PGDP52209 483 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ICA1Q05084 483 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 FAXCQ5TGI0 409 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 GLG1Q92896 1179 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 RFKQ969G6 155 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MUL1Q969V5 352 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PBKQ96KB5 322 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 GLOD4Q9HC38 313 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 DKK3Q9UBP4 350 aa5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ABCA6Q8N139 1617 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MGST3O14880 152 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 COQ9O75208 318 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 IGLV2-14P01704 120 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 CHRM2P08172 466 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 SLC5A2P31639 672 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 RARRES1P49788 294 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 GATMP50440 423 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 GRM1Q13255 1194 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 TRIM14Q14142 442 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 TXNRD1Q16881 649 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ZNF618Q5T7W0 954 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 WDR63Q8IWG1 891 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 GRPEL1Q9HAV7 217 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 EHD3Q9NZN3 535 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 IFT172Q9UG01 1749 aa5.79□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 OR2W5A6NFC9 320 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ONECUT2O95948 504 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ARP10275 920 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 LIPAP38571 399 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 TIRAPP58753 221 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 FHL3Q13643 280 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 BMPR2Q13873 1038 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 TREML2Q5T2D2 321 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 KAZNQ674X7 775 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 GGT6Q6P531 493 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 TFAP2BQ92481 460 aa5.78□□□□□ -1.48
TRDN-204ENST00000542443 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms