RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516666.1

RNU6-1332P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1332, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1332P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FYB1O15117 783 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KPNA5O15131 536 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CBFA2T3O75081 653 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IGKV2-30P06310 120 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CD63P08962 238 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARP10275 920 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 THBS4P35443 961 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NR4A2P43354 598 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CFHR1Q03591 330 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC14A1Q13336 389 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FHL3Q13643 280 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ATP1A4Q13733 1029 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 Q4G0T1 1027 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PMM1Q92871 262 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LRRC46Q96FV0 321 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NUAK2Q9H093 628 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 VPS45Q9NRW7 570 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CA14Q9ULX7 337 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PMM2O15305 246 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CA12O43570 354 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TLR2O60603 784 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PRAMEF2O60811 474 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CAND2O75155 1236 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CTSAP10619 480 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 EGR1P18146 543 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MST1P26927 711 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GABRB3P28472 473 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GALNSP34059 522 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TM4SF4P48230 202 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PRIM2P49643 509 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SEC23BQ15437 767 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CNGA3Q16281 694 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARL13BQ3SXY8 428 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GDF15Q99988 308 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FAM50BQ9Y247 325 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 INPPL1O15357 1258 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FGF18O76093 207 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SGPL1O95470 568 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 VIPP01282 170 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GNALP38405 381 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PBX1P40424 430 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC12A2P55011 1212 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MAPK7Q13164 816 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SEMA3BQ13214 749 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RABEP1Q15276 862 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 AWAT1Q58HT5 328 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCDC181Q5TID7 509 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SHC4Q6S5L8 630 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TTC30AQ86WT1 665 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF366Q8N895 744 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TBCBQ99426 244 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TRMOQ9BU70 441 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms