RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-205ENST00000391970 GJD2Q9UKL4 321 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-205ENST00000391970 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-205ENST00000391970 AVPR1BP47901 424 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-205ENST00000391970 SEC24CP53992 1094 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-205ENST00000391970 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-205ENST00000391970 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-205ENST00000391970 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-205ENST00000391970 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRC-205ENST00000391970 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.57□□□□□ -1.84
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