RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 P4HA1P13674 534 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PCSK2P16519 638 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CXCR2P25025 360 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 VHLP40337 213 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MAGEA11P43364 429 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PCP4P48539 62 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 NCALDP61601 193 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ADAM17P78536 824 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 BEX3Q00994 111 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PLD1Q13393 1074 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DLGAP5Q15398 846 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 QPCTQ16769 361 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ADGRF4Q8IZF3 695 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM47Q96LD4 638 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MFSD14AQ96MC6 490 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MRIQ9BWK5 157 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 IDI2Q9BXS1 227 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 RIOX1Q9H6W3 641 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC78A2IDD5 438 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 LRRIQ4A6NIV6 560 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PP2D1A8MPX8 630 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 BTN3A1O00481 513 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MTSS1O43312 755 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PEX11AO75192 247 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ACTN1P12814 892 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 EEF2P13639 858 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 CPB1P15086 417 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PDGFRAP16234 1089 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 BMP6P22004 513 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MAN2A2P49641 1150 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SULT1E1P49888 294 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SCNN1GP51170 649 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SLC12A2P55011 1212 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 STX17P56962 302 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MORC3Q14149 939 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ERV3-1Q14264 604 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GANCQ8TET4 914 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 RASSF5Q8WWW0 418 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SHC3Q92529 594 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 LPPQ93052 612 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SGF29Q96ES7 293 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM68Q96MH6 324 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 FRMD6Q96NE9 622 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TINF2Q9BSI4 451 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DESI2Q9BSY9 194 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 RAB34Q9BZG1 259 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TUFT1Q9NNX1 390 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 NMRK1Q9NWW6 199 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 FAM198AQ9UFP1 575 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ERVK-19Q9WJR5 959 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 ESYT2A0FGR8 921 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 USP17L10C9JJH3 530 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 H0Y858 1186 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 LINC01387J3KSC0 135 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 PSMD9O00233 223 aa5.13□□□□□ -1.59
CLVS1-201ENST00000325897 BMP10O95393 424 aa5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 469.7 ms