RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 UGT1A10Q9HAW8 530 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 UGT1A8Q9HAW9 530 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ERAP1Q9NZ08 941 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 MGAMO43451 1857 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 IL18RAPO95256 599 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 DPH6Q7L8W6 267 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC4A11Q8NBS3 891 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 IKBKGQ9Y6K9 419 aa18.5■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 EVPLQ92817 2033 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 MAGEA13PA6NCF6 341 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ERBB2P04626 1255 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ANPEPP15144 967 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 C1orf146Q5VVC0 180 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 NPNTQ6UXI9 565 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 RILPQ96NA2 401 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ELOVL4Q9GZR5 314 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPN7P35236 360 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PEX6Q13608 980 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 LPCAT4Q643R3 524 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 RAPH1Q70E73 1250 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 XYLT1Q86Y38 959 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PPM1NQ8N819 430 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 GSTCDQ8NEC7 633 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 EBF4Q9BQW3 602 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 EBF3Q9H4W6 596 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ACSS3Q9H6R3 686 aa18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 KBTBD13C9JR72 458 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 VTNP04004 478 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ITGAVP06756 1048 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 OSBPP22059 807 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 RANBP1P43487 201 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 TMPRSS15P98073 1019 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC142Q17RM4 750 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 POLNQ7Z5Q5 900 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 CDCA5Q96FF9 252 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 VPS11Q9H270 941 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PIK3R2O00459 728 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PHBP35232 272 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PHKA2P46019 1235 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC18A1P54219 525 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 AQP5P55064 265 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC25A3Q00325 362 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 MROH8Q9H579 483 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 AKT3Q9Y243 479 aa18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 MICAL2O94851 1124 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 CYP2C8P10632 490 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP8P85298 464 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 USP4Q13107 963 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PPIL2Q13356 520 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 AMHR2Q16671 573 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ARMCX2Q7L311 632 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SCUBE1Q8IWY4 988 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PPIL6Q8IXY8 311 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 HSPH1Q92598 858 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM176AQ96HP8 235 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF181Q9P0P0 153 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ANK1P16157 1881 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM49D1C9J1S8 452 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 INHBAP08476 426 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 KRT7P08729 469 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 KDELR1P24390 212 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 EPHB1P54762 984 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP1Q07960 439 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 BST1Q10588 318 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 HADHQ16836 314 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 NAT8LQ8N9F0 302 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 CXorf38Q8TB03 319 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 UBA3Q8TBC4 463 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.47■□□□□ 0.55
TSPAN17-201ENST00000298564 PCDH9Q9HC56 1237 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms