RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2H3Q13889 308 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 ADAM32Q8TC27 787 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 SUPT7LO94864 414 aa21.35■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa21.35■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 TNFSF9P41273 254 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
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PTPRJ-208ENST00000615445 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 STMN1P16949 149 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 SSTR1P30872 391 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-208ENST00000615445 MPP3Q13368 585 aa21.34■■□□□ 1.01
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