RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541696.1

QKI-212, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, humanhuman

TSL 2

Gene QKI, Length 1,097 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKI-212ENST00000541696 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 A0A087X0T9 212 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 C9IYK1 514 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 EXOC3O60645 756 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TBX10O75333 385 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 FAM228BP0C875 321 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 VDRP11473 427 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ALAS1P13196 640 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ITGA4P13612 1032 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CFPP27918 469 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 MCM7P33993 719 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CETN2P41208 172 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PRKCIP41743 596 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SLCO1A2P46721 670 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 EVA1CP58658 441 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 LPIN1Q14693 890 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 BCL2A1Q16548 175 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PDK4Q16654 411 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CGB2Q6NT52 195 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 Q6ZNX1 250 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CENPUQ71F23 418 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 RASSF3Q86WH2 238 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SFR1Q86XK3 245 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 HID1Q8IV36 788 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 NRG4Q8WWG1 115 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 GAB3Q8WWW8 586 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 RFFLQ8WZ73 363 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 JADE3Q92613 823 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ART4Q93070 314 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 MFSD3Q96ES6 412 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 BIRC8Q96P09 236 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TRIM9Q9C026 710 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 DKK3Q9UBP4 350 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SNX24Q9Y343 169 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PXDNQ92626 1479 aa7.35□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CCDC160A6NGH7 325 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 EPHB6O15197 1021 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 KCNQ3O43525 872 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CYTH3O43739 400 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZBED1O96006 694 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ABHD2P08910 425 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 T-ENOLP0DO92 83 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ETS2P15036 469 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZNF12P17014 697 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 FGFR4P22455 802 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PHBP35232 272 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 PGM1P36871 562 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 STAT3P40763 770 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 GALK1P51570 392 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 NUP107P57740 925 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TIMM10P62072 90 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 COG7P83436 770 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TMEM62Q0P6H9 643 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 CDC16Q13042 620 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 TCIRG1Q13488 830 aa7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
QKI-212ENST00000541696 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.6 ms