RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	SPRY2	O43597	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	VIP	P01282	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	CREB1	P16220	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	FPR3	P25089	353 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ITPKB	P27987	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	SLC5A2	P31639	672 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ELF2	Q15723	593 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	COL15A1	P39059	1388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	USP1	O94782	785 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	TJP3	O95049	919 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	NUDT3	O95989	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61	7e-7	■□□□□ 9.6
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	PSG6	Q00889	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ICA1	Q05084	483 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	UROC1	Q96N76	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF213	O14771	459 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	NPC1	O15118	1278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CA12	O43570	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	WDR47	O94967	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	FGA	P02671	866 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	DRD1	P21728	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	MCM5	P33992	734 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PBX1	P40424	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CYP4F2	P78329	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	WDR24	Q96S15	920 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	TIMP4	Q99727	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334		A8MVJ9	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334		J3KTA2	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334		M0R3H8	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	ASNA1	O43681	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-231	ENST00000477334	EXOC3	O60645	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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