RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567542.5

PRMT7-223, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, human

TSL 1 (best)

Gene PRMT7, Length 3,542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT7-223	ENST00000567542	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	USP1	O94782	785 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	DES	P17661	470 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PDE1B	Q01064	536 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TDRP	Q86YL5	185 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	MAGEB2	O15479	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ITGAV	P06756	1048 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	AMPD1	P23109	780 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	CDKN2B	P42772	138 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	OGDH	Q02218	1023 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PTP4A2	Q12974	167 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TMEM63A	O94886	807 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542		M0QYV0	167 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	CYB561D2	O14569	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	B4GALT5	O43286	388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	KRT38	O76015	456 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	VNN1	O95497	513 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	CDH8	P55286	799 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PMM2	O15305	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	BST1	Q10588	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TAF5	Q15542	800 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	LYPLA2	O95372	231 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	VTN	P04004	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	BCAR1	P56945	870 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ASPH	Q12797	758 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	CAPS	Q13938	189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	HIC1	Q14526	733 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	OAZ1	P54368	228 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	DSG1	Q02413	1049 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	STX3	Q13277	289 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	DPYSL3	Q14195	570 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	AHCYL1	O43865	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	OSBP	P22059	807 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TAP1	Q03518	808 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRMT7-223	ENST00000567542	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms