RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622186.4

SLC6A6-210, Transcript of solute carrier family 6 member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A6, Length 6,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A6-210ENST00000622186 PDILTQ8N807 584 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 PDE3BQ13370 1112 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 E9PSI1 815 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 ATP2B1P20020 1258 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 MNS1Q8NEH6 495 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 KCNA4P22459 653 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 TXLNAP40222 546 aa14.58□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.58□□□□□ -0.07
SLC6A6-210ENST00000622186 ERC2O15083 957 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 EEA1Q15075 1411 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 REC8O95072 547 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.57□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 EVC2Q86UK5 1308 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 ERLIN2O94905 339 aa14.56□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 ZNF76P36508 570 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 UQCRHP07919 91 aa14.55□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 H0YHG0 523 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 SOGA3Q5TF21 947 aa14.54□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.53□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 CEP162Q5TB80 1403 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.52□□□□□ -0.08
SLC6A6-210ENST00000622186 IL27Q8NEV9 243 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 CCDC181Q5TID7 509 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 SMARCE1Q969G3 411 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 FSD1Q9BTV5 496 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 IFT57Q9NWB7 429 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 SDF4Q9BRK5 362 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.49□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.49□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 ADAMTS2O95450 1211 aa14.49□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 ROCK1Q13464 1354 aa14.49□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 ANAPC15P60006 121 aa14.49□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.48□□□□□ -0.09
SLC6A6-210ENST00000622186 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms