RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	PPT2	Q12036	173 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	NRG2	P38082	220 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	YHR130C	P38834	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	ENV10	Q99382	181 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	YBR219C	P38317	127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	COX14	P39103	70 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	ERG28	P40030	148 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	HAL1	Q01766	294 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	TOA2	P32774	122 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	YIA6	P40556	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	CWP2	P43497	92 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	RUB1	Q03919	77 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MIA40	YKL195W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	HPA2	Q06592	156 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	RPR2	P40571	144 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	SPC1	P46965	94 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	EOS1	P53938	366 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	ATX1	P38636	73 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	HUR1	P45820	110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	RGM1	Q00453	211 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	YAL065C	O13511	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	COX10	P21592	462 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	DSE2	P38844	325 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	SVP26	P38869	228 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	RPC10	P40422	70 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	ABF2	Q02486	183 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	OST2	P46964	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MIA40	YKL195W	YAL064W	P39711	94 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	RTC6	O14464	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	PBA1	Q05778	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	INO4	P13902	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	AIM19	P40502	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	MVB12	P42939	101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	KNH1	P50112	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	AQY2	P0CD90	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
MIA40	YKL195W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YDR115W	Q04598	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	IRC21	Q04772	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	AUA1	P32450	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YCR085W	P25650	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YFL019C	P43576	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MIA40	YKL195W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	ICY1	Q04329	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	SNA2	P56508	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	MSA2	P36157	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	MPC3	P53311	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	STF1	P01098	86 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	YFL065C	P43539	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MIA40	YKL195W	UBC4	P15731	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	DYN1	P36022	4092 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	SMP1	P38128	452 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	IGD1	P43598	195 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	FYV5	P25585	152 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	HOT13	P36078	116 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	ATP18	P81450	59 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	ECM12	O13529	151 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MIA40	YKL195W	RAD6	P06104	172 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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