RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 TKTL1P51854 596 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 MIIPQ5JXC2 388 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 TMCC1O94876 653 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 TRADDQ15628 312 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 NFIL3Q16649 462 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SETSIPP0DME0 302 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 HMOX2P30519 316 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ACVR2BQ13705 512 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 COPS5Q92905 334 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ASTN1O14525 1302 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 MGEA5O60502 916 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 HIST1H2ADP20671 130 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 CHI3L2Q15782 390 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 TBCCQ15814 346 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 POMCP01189 267 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 LGALS2P05162 132 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2BQ00403 316 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 DGKZQ13574 1117 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFRSF25Q93038 417 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ACP6Q9NPH0 428 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO21O94952 628 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SYT15Q9BQS2 421 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 CASS4Q9NQ75 786 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 KPNA6O60684 536 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SERPINB4P48594 390 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC11A2P49281 568 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGDIAP52565 204 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SGF29Q96ES7 293 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 APOL2Q9BQE5 337 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 RRAGCQ9HB90 399 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 STK25O00506 426 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 PYGLP06737 847 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.45■■□□□ 1.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 PDHA1P08559 390 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 GLRA2P23416 452 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 POLE2P56282 527 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 PTK6Q13882 451 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 MFSD10Q14728 455 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 ASMTLO95671 621 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 GHRP10912 638 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 YAF2Q8IY57 180 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 MYO1DO94832 1006 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 JCHAINP01591 159 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKCIP41743 596 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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PTPRJ-208ENST00000615445 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 NUMBP49757 651 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNMA1Q12791 1236 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 DSEQ9UL01 958 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 NFAT5O94916 1531 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 ANGPT2O15123 496 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 ADRB2P07550 413 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 RARAP10276 462 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 AKR1A1P14550 325 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 CREG2Q8IUH2 290 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 MFN1Q8IWA4 741 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 GJB6O95452 261 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-208ENST00000615445 GEMP55040 296 aa21.44■■□□□ 1.02
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