RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSTR1P30872 391 aa17.21■□□□□ 0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED21Q13503 144 aa17.21■□□□□ 0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.21■□□□□ 0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NSL1Q96IY1 281 aa17.21■□□□□ 0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IKZF4Q9H2S9 585 aa17.21■□□□□ 0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETD4Q9NVD3 440 aa17.21■□□□□ 0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 V9GYQ6 96 aa17.21■□□□□ 0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.21■□□□□ 0.35
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPST1O60507 370 aa17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDNO94850 711 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBOX5O94941 541 aa17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AVPR1AP37288 418 aa17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIIPQ5JXC2 388 aa17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMC3Q7Z5M5 1100 aa17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM176AQ96HP8 235 aa17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIDD1Q9HB75 910 aa17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMAPO00193 183 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKAP10O43572 662 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THPOP40225 353 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLC1Q07866 573 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYBPC2Q14324 1141 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPRE2Q15555 327 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELMOD1Q8N336 334 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KAT2BQ92831 832 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC3BQ9H195 1237 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENO4A6NNW6 628 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JCHAINP01591 159 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF844Q08AG5 666 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHST12Q9NRB3 414 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHST7Q9NS84 486 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL10P22301 178 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXD10P28358 340 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCTRP47872 440 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC9Q8WXX5 260 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AP4E1Q9UPM8 1137 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SGO1Q5FBB7 561 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf186Q6ZWK4 172 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNK16Q96T55 309 aa17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYB561D2O14569 222 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR49Q8IV35 697 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3KBP1Q96B97 665 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CMTM5Q96DZ9 223 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX5Q9Y5X3 404 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRRG1O14668 218 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCND1P24385 295 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC23LQ6PF05 361 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL2O95198 593 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYBL2P10244 700 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2C8P10632 490 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPN7P35236 360 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLIN5Q00G26 463 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENDOD1O94919 500 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHRM3P20309 590 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKAP5P24588 427 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNPLA4P41247 253 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDST1P52848 882 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FKBP1CQ5VVH2 108 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN16Q9UKR8 245 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDY2AQ9Y6F7 541 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDY1Q9Y6F8 540 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASSF10A6NK89 507 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIPK2O43353 540 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKT1P31749 480 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DSG3P32926 999 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCL1Q07820 350 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNTG2Q9NY99 539 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNPEPQ9ULA0 475 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8VP50 259 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP3K7CLP57077 242 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCUBE3Q8IX30 993 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP4F12Q9HCS2 524 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM247A6NEH6 219 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUPT3HB4E1H0 165 aa17.18■□□□□ 0.34
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUPT3HO75486 399 aa17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms