RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 RFX6Q8HWS3 928 aa27.07■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 PALM2Q8IXS6 379 aa27.07■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 FBXO36Q8NEA4 188 aa27.07■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 POLIQ9UNA4 740 aa27.07■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 HGSO14964 777 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 CA12O43570 354 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 LGR5O75473 907 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 ADORA2AP29274 412 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 RASSF2P50749 326 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 RAD23BP54727 409 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 KCTD6Q8NC69 237 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 MZB1Q8WU39 189 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 FGD4Q96M96 766 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SYNCQ9H7C4 482 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 A8MUI8 341 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 MCF2LO15068 1137 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 ALDH1A1P00352 501 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SLC45A4Q5BKX6 768 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 KCNT1Q5JUK3 1230 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 OTOAQ7RTW8 1153 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 PLEKHH3Q7Z736 793 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 FZD8Q9H461 694 aa27.06■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 C2CD2LO14523 706 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 RNF8O76064 485 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 GABRB2P47870 512 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 GAD2Q05329 585 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 UNC45BQ8IWX7 931 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 NSMCE1Q8WV22 266 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 DCAKDQ8WVC6 231 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 CPXM1Q96SM3 734 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 RSAD1Q9HA92 442 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 LRRC37A2A6NM11 1700 aa27.05■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 MCRS1Q96EZ8 462 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 VPS11Q9H270 941 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 TJP2Q9UDY2 1190 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 ZBTB42B2RXF5 422 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 TMEM63AO94886 807 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 ERBB2P04626 1255 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 LRRC71Q8N4P6 559 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 BANPQ8N9N5 519 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 CYTH2Q99418 400 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 ASNSD1Q9NWL6 643 aa27.04■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 MIPP30301 263 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 STIP1P31948 543 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 PCK1P35558 622 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 RAP1GAPP47736 663 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SLC8A3P57103 927 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 CBLBQ13191 982 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 GRB14Q14449 540 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 ZNF792Q3KQV3 632 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 BBS9Q3SYG4 887 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 C10orf88Q9H8K7 445 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 ANK1P16157 1881 aa27.03■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 PLXNB2O15031 1838 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SPAG6O75602 509 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 CD48P09326 243 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 PSMC4P43686 418 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 DPYSL3Q14195 570 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 EMC1Q8N766 993 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SLC4A11Q8NBS3 891 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 GPR20Q99678 358 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SAR1AQ9NR31 198 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 USP18Q9UMW8 372 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 KRT19P08727 400 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 RBP3P10745 1247 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 ADRA1DP25100 572 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 TARSP26639 723 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 MARK3P27448 753 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 CCNG1P51959 295 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 LY6KQ17RY6 165 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 FAM71DQ8N9W8 422 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 CYP3A43Q9HB55 503 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 SIX4Q9UIU6 781 aa27.02■■□□□ 1.92
OPN3-204ENST00000469376 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms