RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 VPS51Q9UID3 782 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 CA14Q9ULX7 337 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 FZD1Q9UP38 647 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SNX14Q9Y5W7 946 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC189A1A4V9 331 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 ASNA1O43681 348 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 COQ9O75208 318 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TNFRSF6BO95407 300 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 NPPBP16860 134 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 PGDP52209 483 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SP2Q02086 613 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 GPS1Q13098 491 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TIGD2Q4W5G0 525 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LNX2Q8N448 690 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ASB10Q8WXI3 467 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LPIN2Q92539 896 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 EID2BQ96D98 161 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 HS3ST4Q9Y661 456 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ZAR1LA6NP61 321 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 AGPSO00116 658 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 PDHA1P08559 390 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 EPHA3P29320 983 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 NTSR1P30989 418 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 ATP1A4Q13733 1029 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 PRKG1Q13976 671 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 POSTNQ15063 836 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 DTX2Q86UW9 622 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 SYNE4Q8N205 404 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 EVI5LQ96CN4 794 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-205ENST00000391970 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.66□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 COL15A1P39059 1388 aa3.65□□□□□ -1.82
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 DHHO43323 396 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 NTSR2O95665 410 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 VIPP01282 170 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ERBB2P04626 1255 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 RHOP08100 348 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ITGA2BP08514 1039 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 DHRS4L1P0CG22 281 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 ITGAMP11215 1152 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 RBL1P28749 1068 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 HTR7P34969 479 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 CCT5P48643 541 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-205ENST00000391970 GATMP50440 423 aa3.65□□□□□ -1.83
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