RNA–Protein interactions for RNA: YHR106W

TRR2, Transcript of Mitochondrial thioredoxin reductase, yeast

Gene TRR2, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRR2	YHR106W	RPC10	P40422	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRR2	YHR106W	MED7	Q08278	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRR2	YHR106W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRR2	YHR106W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TRR2	YHR106W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TRR2	YHR106W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TRR2	YHR106W	OST3	P48439	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YGL118C	P53132	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	AIM29	P36154	155 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YBR209W	P38311	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YEL008W	P40001	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	GTT1	P40582	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	PCL2	P25693	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	NSE4	P43124	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	CYT2	Q00873	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YBR219C	P38317	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YGL088W	P53151	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	ERV14	P53173	138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	CIN5	P40917	295 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	DUT1	P33317	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YER085C	P40058	173 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRR2	YHR106W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	APS1	P35181	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	YAL064W	P39711	94 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	LCL1	Q02786	101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	YAL065C	O13511	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	SNA2	P56508	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	MET32	Q12041	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	SMP1	P38128	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
TRR2	YHR106W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	YKL069W	P36088	180 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRR2	YHR106W	YKL070W	P36087	169 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	COX14	P39103	70 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	PPT2	Q12036	173 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	ATP15	P21306	62 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	TOA2	P32774	122 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	YER134C	P40081	178 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	ECM12	O13529	151 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	STF1	P01098	86 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	SHU1	P38751	150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	PEX22	P39718	180 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	ARL3	Q02804	198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	AQY2	P0CD90	149 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	AIM11	P87275	137 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	QCR8	P08525	94 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	PEX17	P40155	199 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	AIM19	P40502	157 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	MMS2	P53152	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	YML108W	Q03759	105 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRR2	YHR106W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	CNL1	Q06333	122 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	PAU16	P35994	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	OXA1	P39952	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	YFL067W	P43537	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	HAP3	P13434	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	MVB12	P42939	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	CWP2	P43497	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	YFL019C	P43576	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	YKR041W	P36134	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	ABF2	Q02486	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	MHR1	Q06630	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRR2	YHR106W	YKL044W	P36092	106 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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