RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBC1D5Q92609 795 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 DLL3Q9NYJ7 618 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A087WWL8 130 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFAP69A5D8W1 941 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAPN8A6NHC0 703 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 H0YIZ8 118 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM22K7EJ46 135 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCGB1D2O95969 90 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCSK6P29122 969 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADORA2AP29274 412 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDE6CP51160 858 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARFIP2P53365 341 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 WNT3P56703 355 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC13A2Q13183 592 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB32Q13637 225 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLA1AQ53H76 456 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 JDP2Q8WYK2 163 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPF1Q92782 380 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUSP22Q9NRW4 184 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 EID1Q9Y6B2 187 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM233B4DJY2 109 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPSP0C0P6 89 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 DGKEP52429 567 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 TFF2Q03403 129 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOXF2Q12947 444 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 LY6KQ17RY6 165 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL31RAQ8NI17 732 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 RUNDC1Q96C34 613 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf112Q9NSG2 853 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP19O94966 1318 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC01548A6NM66 108 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM227AF5H4B4 570 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF213O14771 459 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERC2O15083 957 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSF1RP07333 972 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 BRAFP15056 766 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNA3P22001 575 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 TPTEP56180 551 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYP4F2P78329 520 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 MLC1Q15049 377 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPARTQ8N0X7 666 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABRAQ8N0Z2 381 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGEB6Q8N7X4 407 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SUCLG2Q96I99 432 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPH1Q9BZG8 443 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-38P-201ENST00000384085 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms