RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	BCO2	Q9BYV7	579 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	OBP2A	Q9NY56	170 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TECTA	O75443	2155 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	AKAP3	O75969	853 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GNA14	O95837	355 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GJA1	P17302	382 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ATF6	P18850	670 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	AOC1	P19801	751 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	BDNF	P23560	247 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PRCP	P42785	496 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEA9	P43362	315 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MXI1	P50539	228 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC8A3	P57103	927 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DDR2	Q16832	855 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM171B	Q6P995	826 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SV2A	Q7L0J3	742 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	UNC93A	Q86WB7	457 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	STKLD1	Q8NE28	680 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF516	Q92618	1163 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GBP4	Q96PP9	640 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TSC2	P49815	1807 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	VNN2	O95498	520 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	HLA-DRA	P01903	254 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GLUL	P15104	373 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNE1	P24864	410 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	LMO2	P25791	158 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G5	P39877	138 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GCLM	P48507	274 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GRM2	Q14416	872 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	OSTM1	Q86WC4	334 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TMC8	Q8IU68	726 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PCED1B	Q96HM7	432 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM84A	Q96KN4	292 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA17	Q96L03	361 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP63	Q96MT8	703 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DACH1	Q9UI36	760 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CHAD	O15335	359 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	NOL4	O94818	638 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ABL1	P00519	1130 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CKM	P06732	381 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	USP17L7	P0C7H9	530 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	PFKL	P17858	780 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	WEE1	P30291	646 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CCR2	P41597	374 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TTLL3-231	ENST00000496246	CDR1	P51861	262 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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