RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444502.5

TOP3B-210, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 4,163 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-210ENST00000444502 COL4A1P02462 1669 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 BRAFP15056 766 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 SLC12A2P55011 1212 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 CDH6P55285 790 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 INHBEP58166 350 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 ARL13BQ3SXY8 428 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.1□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 PIDD1Q9HB75 910 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.1□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 CHN1P15882 459 aa11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 C15orf41Q9Y2V0 281 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 FAM107AO95990 144 aa11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 ZNF131P52739 623 aa11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 ZFATQ9P243 1243 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 NR2E1Q9Y466 385 aa11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 ZNF862O60290 1169 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 SPAG7O75391 227 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 MAP3K6O95382 1288 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 PHBP35232 272 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 PTENP60484 403 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 SEPT6Q14141 434 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 CFAP157Q5JU67 520 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.09□□□□□ -0.63
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TOP3B-210ENST00000444502 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3B-210ENST00000444502 CD4P01730 458 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-210ENST00000444502 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-210ENST00000444502 KCNA3P22001 575 aa11.08□□□□□ -0.64
TOP3B-210ENST00000444502 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
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