RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Osbpl6Q8BXR9 959 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tctn1Q8BZ64 593 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spice1Q8C804 860 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc23Q8CHY7 488 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sbk1Q8QZX0 417 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ces4aQ8R0W5 563 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn1r213Q8R278 384 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf445Q8R2V3 986 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem161aQ8VCA6 480 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gripap1Q8VD04 806 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bloc1s4Q8VED2 215 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lzts2Q91YU6 671 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mlf2Q99KX1 247 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q9CQM1 111 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lman1Q9D0F3 517 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Extl2Q9ES89 330 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fgf22Q9ESS2 162 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Noc2lQ9WV70 747 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wnk2Q3UH66 2149 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aox1O54754 1333 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abcb11Q9QY30 1321 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AcacbE9Q4Z2 2448 aa5.93□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm7356A0A087WSA6 508 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Awat1A2ADU9 328 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lin7bO88951 207 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01649 108 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01652 108 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GnaqP21279 359 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PtmaP26350 111 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gmeb2P58929 530 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pcif1P59114 706 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nup43P59235 380 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Erbb2P70424 1256 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Grm2Q14BI2 872 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfyve27Q3TXX3 415 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam20cQ5MJS3 579 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rhpn1Q61085 643 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nuak1Q641K5 658 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Foxl1Q64731 336 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Git1Q68FF6 770 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mysm1Q69Z66 819 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Akap7Q7TN79 314 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AmphQ7TQF7 686 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nsun6Q7TS68 476 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Galnt17Q7TT15 598 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nrde2Q80XC6 1172 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ToporsQ80Z37 1033 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ubxn10Q8BG34 277 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Samd7Q8C8Y5 445 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 KinQ8K339 391 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sirt3Q8R104 334 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acsf2Q8VCW8 615 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cbx7Q8VDS3 158 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc25a38Q91XD8 326 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mcm8Q9CWV1 833 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc7Q9D541 371 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 1700069L16RikQ9D9H5 109 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab27aQ9ERI2 221 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spry1Q9QXV9 313 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nr4a3Q9QZB6 627 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sel1lQ9Z2G6 790 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Akap13E9Q394 2776 aa5.92□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm45015A0A140LII9 184 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm18336A0A140LIU8 765 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdr2lA2A6T1 465 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Map7d2A2AG50 781 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adam6aB2RSY5 754 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm2956E9PVJ0 216 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NcapgE9PWG6 1004 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r23E9PXI5 849 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r87E9PZX4 848 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BC051665E9Q623 330 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8108K7N734 216 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3488M0QW81 238 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Actn3O88990 900 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tnfrsf4P47741 272 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MafP54843 370 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PtpaP58389 323 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Polr3bP59470 1133 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RenbpP82343 430 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mark3Q03141 753 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prss48Q14B25 312 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Asphd1Q2TA57 360 aa5.91□□□□□ -1.46
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.8 ms