RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622814.4

IRX4-208, Transcript of iroquois homeobox 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX4, Length 2,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRX4-208	ENST00000622814	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	MAML1	Q92585	1016 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	GPR20	Q99678	358 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	CD48	P09326	243 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	GDF10	P55107	478 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814		A0A0G2JMZ2	1700 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		21.34	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	CLCN3	P51790	818 aa		21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	LRRC38	Q5VT99	294 aa		21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	SPATA21	Q7Z572	469 aa		21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		21.33	■■□□□ 1.01
IRX4-208	ENST00000622814	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	GRM1	Q13255	1194 aa		21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SPOCK2	Q92563	424 aa		21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SDCBP2	Q9H190	292 aa		21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PNMA3	Q9UL41	463 aa		21.33	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	LRCH4	O75427	683 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	IQCF3	P0C7M6	154 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	KRT3	P12035	628 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	TAF5	Q15542	800 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	TWNK	Q96RR1	684 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	CPXM1	Q96SM3	734 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	CEP83	Q9Y592	693 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SOCS7	O14512	581 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SUN1	O94901	812 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	TNNC2	P02585	160 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SNCB	Q16143	134 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	CCDC63	Q8NA47	563 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ACTL9	Q8TC94	416 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	TCP11	Q8WWU5	503 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	CST8	O60676	142 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	NFIC	P08651	508 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ABHD2	P08910	425 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	TAC1	P20366	129 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	NRL	P54845	237 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	DPH6	Q7L8W6	267 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	TRABD2A	Q86V40	505 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	MAGEB18	Q96M61	343 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SIX4	Q9UIU6	781 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PIK3R2	O00459	728 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	IRF6	O14896	467 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	KRT15	P19012	456 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	PROZ	P22891	400 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	COPS2	P61201	443 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	IGBP1	P78318	339 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	MGAT5	Q09328	741 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	OTUD5	Q96G74	571 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	FAM167A	Q96KS9	214 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	FGD4	Q96M96	766 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	SPATA33	Q96N06	139 aa		21.31	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		21.3	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		21.3	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ERBB2	P04626	1255 aa		21.3	■■□□□ 1
IRX4-208	ENST00000622814	ITGAV	P06756	1048 aa		21.3	■■□□□ 1

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