RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PARM1	Q6UWI2	310 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	VSTM1	Q6UX27	236 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOC4	Q96A65	974 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ASIC4	Q96FT7	647 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM209	Q96SK2	561 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	KXD1	Q9BQD3	176 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	BRD9	Q9H8M2	597 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP72	Q9P209	647 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CA14	Q9ULX7	337 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC3A	Q02505	3323 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GABRD	O14764	452 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF263	O14978	683 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PDGFRB	P09619	1106 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMC3	P17980	439 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	AVPR2	P30518	371 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF2H1	P32780	548 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	AVPR1A	P37288	418 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	EPHA5	P54756	1037 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	WNT7B	P56706	349 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MYL6	P60660	151 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2H	P62256	183 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKCQ	Q04759	706 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TEAD2	Q15562	447 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR44	Q5JSH3	913 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR158	Q5T848	1215 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC39C	Q8N584	583 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GIPC2	Q8TF65	315 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FGF14	Q92915	247 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	NELL2	Q99435	816 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MED10	Q9BTT4	135 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SOBP	A7XYQ1	873 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MAN2B1	O00754	1011 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEA11	P43364	429 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	AMPD2	Q01433	879 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT39	Q6A163	491 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR152	Q8TDT2	470 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	DNASE1L2	Q92874	299 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB16	Q96NS5	453 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TASP1	Q9H6P5	420 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SOAT2	O75908	522 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2F1	P24903	491 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GDI1	P31150	447 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP3CC	P48454	512 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP4	P49662	377 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GPC5	P78333	572 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN10	P78369	228 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCB2	Q00722	1185 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ZACN	Q401N2	412 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MYLPF	Q96A32	169 aa		12.09	□□□□□ -0.47

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