RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000126429.7

Ccdc171-204, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc171, Length 1,388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 4933406M09RikG3XA12 479 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 KlO35082 1014 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Hoxb8P09632 243 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Abi2P62484 446 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Mcl1P97287 331 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 MylpfP97457 169 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Adamts1P97857 968 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tcerg1lQ3B807 590 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Aarsd1Q3THG9 412 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Zscan4fQ3URS2 506 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ttc9Q3V038 219 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Bbof1Q3V079 533 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fnip1Q68FD7 1165 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Snx19Q6P4T1 997 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pcsk9Q80W65 694 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Cyp4f13Q99N19 523 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Klhl10Q9D5V2 608 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Znf354bQ9QXT9 601 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Nek3Q9R0A5 511 aa14.95□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 A0A286YCQ6 122 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gm1993A6X8I0 212 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 SlxD3Z347 212 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 4930444G20RikD3Z741 495 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tcp10bE9PYJ0 438 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tcp10cE9Q046 482 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Cacna2d1O08532 1103 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tnfrsf18O35714 228 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Trappc3O55013 180 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 P01652 108 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ccl4P14097 92 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Abcd1P48410 736 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Zfp512bQ6PHP4 879 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gpr62Q80UC6 358 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Trim35Q8C006 501 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pcdha7Q91Y13 937 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ttc1Q91Z38 292 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tgs1Q923W1 853 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Smtnl1Q99LM3 459 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Drap1Q9D6N5 205 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Plxna3P70208 1872 aa14.94□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 DgkaO88673 730 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Hk1P17710 974 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Vamp7P70280 220 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Lig3P97386 1015 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Wbp2P97765 261 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Cyp2c65Q148B1 490 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Trim72Q1XH17 477 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ksr1Q61097 873 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ssr4Q62186 172 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pde1cQ64338 706 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 RbfaQ6P3B9 350 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ttyh3Q6P5F7 524 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 DstykQ6XUX1 927 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Tas2r134Q7TQB0 298 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Slc20a2Q80UP8 656 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fndc3aQ8BX90 1198 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Lin9Q8C735 542 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gtpbp10Q8K013 366 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa14.93□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ism1A2ATD1 454 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Apol6B7ZC55 329 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Hes2O54792 157 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 SlkO54988 1233 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Odc1P00860 461 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Myl1P05977 188 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 AgtP11859 477 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 FasP25446 327 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pik3caP42337 1068 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Adamts8P57110 905 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Krt80Q0VBK2 452 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Q3TTJ4 293 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Ankrd40Q5SUE8 363 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 SheQ8BSD5 492 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 RtknQ8C6B2 564 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fbxl13Q8CDU4 790 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Rtn4rl1Q8K0S5 445 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Igsf8Q8R366 611 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Pcdhb2Q91Y00 799 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fam49bQ921M7 324 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Fam187aQ9D3R5 417 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Smg9Q9DB90 520 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Sept5Q9Z2Q6 369 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Atg2aQ6P4T0 1914 aa14.92□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc171-204ENSMUST00000126429 Znf568E9PYI1 671 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.9 ms