RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638091.1

CACNB4-273, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,061 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-273	ENST00000638091	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-273	ENST00000638091	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-273	ENST00000638091	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-273	ENST00000638091	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-273	ENST00000638091	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-273	ENST00000638091	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-273	ENST00000638091	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-273	ENST00000638091	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ITGB1	P05556	798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	AR	P10275	920 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ABL2	P42684	1182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	OVGP1	Q12889	678 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ILK	Q13418	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	LENG9	Q96B70	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PCYT2	Q99447	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	NDC80	O14777	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	GFPT2	O94808	682 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	EFEMP2	O95967	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	RET	P07949	1114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	DDIT3	P35638	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ABLIM3	O94929	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PAEP	P09466	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	SFTPC	P11686	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	NCAM1	P13591	858 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	GAD2	Q05329	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PSMD6	Q15008	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	INF2	Q27J81	1249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	GLMN	Q92990	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	CDC6	Q99741	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	PODXL	O00592	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	CREB3	O43889	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	NMT2	O60551	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	TADA3	O75528	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	MAN1A1	P33908	653 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	AK2	P54819	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	COG7	P83436	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	AP1B1	Q10567	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	KCNC3	Q14003	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	UBE2S	Q16763	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-273	ENST00000638091	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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