RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	HPCA	P84074	193 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF394	Q53GI3	561 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MIS12	Q9H081	205 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP8B3	O60423	1300 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	P4HA2	O15460	535 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CAPN15	O75808	1086 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	KRT4	P19013	534 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CD97	P48960	835 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PTK6	Q13882	451 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SV2A	Q7L0J3	742 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	LDHD	Q86WU2	507 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SHC3	Q92529	594 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	KCND2	Q9NZV8	630 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	BANF1	O75531	89 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ATP5H	O75947	161 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP3A4	P08684	503 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MLH1	P40692	756 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RARRES1	P49788	294 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MGAT5	Q09328	741 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ECE2	O60344	883 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	HOXD12	P35452	270 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RTP1	P59025	263 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	BBS9	Q3SYG4	887 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CD101	Q93033	1021 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NACA2	Q9H009	215 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	GYG2	O15488	501 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	GSTM4	Q03013	218 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MTMR1	Q13613	665 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ALCAM	Q13740	583 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	GSTA3	Q16772	222 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CENPU	Q71F23	418 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CEP170P1	Q96L14	293 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	LIG4	P49917	911 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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