RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM75PA6NK02 468 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 H0YIN7 160 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 STMND1H3BQB6 276 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 H3BUI4 141 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TNFRSF10BO14763 440 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 STX10O60499 249 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 GREM1O60565 184 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PRLP01236 227 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 CALB2P22676 271 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 VAMP1P23763 118 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TXKP42681 527 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 NT5C2P49902 561 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 CACNA2D1P54289 1103 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 KRT76Q01546 638 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TAF12Q16514 161 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 KLHL35Q6PF15 583 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 DGKHQ86XP1 1220 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TBC1D21Q8IYX1 336 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 NUP93Q8N1F7 819 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGAP24Q8N264 748 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 OR52K2Q8NGK3 314 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 OXER1Q8TDS5 423 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 HSPH1Q92598 858 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ANKS1AQ92625 1134 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ATP6V1E2Q96A05 226 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TTC17Q96AE7 1141 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PIP5K1AQ99755 562 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 DCAF8L1A6NGE4 600 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 KPNA5O15131 536 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 DAB1O75553 588 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TFPTP0C1Z6 253 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 SERPINB3P29508 390 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ATP5OP48047 213 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PCYT1AP49585 367 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 VBP1P61758 197 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 GUCY2DQ02846 1103 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 OASLQ15646 514 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ALFQ53S48 1182 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 FYB2Q5VWT5 728 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ERAP2Q6P179 960 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 USP43Q70EL4 1123 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 LONP2Q86WA8 852 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 CCNYL1Q8N7R7 359 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 RNF169Q8NCN4 708 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 NCLNQ969V3 563 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TNIP3Q96KP6 325 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 RUBCNLQ9H714 662 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 CAAP1Q9H8G2 361 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 VPS37BQ9H9H4 285 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 LUZP4Q9P127 313 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 FBXO10Q9UK96 956 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.21□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 MYH15Q9Y2K3 1946 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 C5orf60A6NFR6 353 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PLOD2O00469 737 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 ENC1O14682 589 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 IKBKBO14920 756 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 MAPK13O15264 365 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 GPC4O75487 556 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 RHOBTB3O94955 611 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 KRT75O95678 551 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 FDX1P10109 184 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 VAV1P15498 845 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 VCLP18206 1134 aa5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CLVS1-201ENST00000325897 PTPN9P43378 593 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms