RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 SUSD6Q92537 303 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 NR6A1Q15406 480 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TTC38Q5R3I4 469 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CREBBPQ92793 2442 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ECE2O60344 883 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CBX5P45973 191 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CEP55Q53EZ4 464 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 IFNEQ86WN2 208 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.537e-6■□□□□ 9.4
ZBED6-202ENST00000550078 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 CD53P19397 219 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SYT1P21579 422 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 RASSF2P50749 326 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MAPK6Q16659 721 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF699Q32M78 642 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 COG1Q8WTW3 980 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SERPINI1Q99574 410 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF302Q9NR11 478 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 IL33O95760 270 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 BPNT1O95861 308 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ALDH4A1P30038 563 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 STAT1P42224 750 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 HSDL2Q6YN16 418 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 DET1Q7L5Y6 550 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 NLNQ9BYT8 704 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TMEM260Q9NX78 707 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF536O15090 1300 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 M0QYV0 167 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 IL1AP01583 271 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 IL1BP01584 269 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 GNSP15586 552 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 BNC1Q01954 994 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 LRRC41Q15345 812 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 XAGE2Q96GT9 111 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PXMP2Q9NR77 195 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZFATQ9P243 1243 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 USP20Q9Y2K6 914 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ANXA5P08758 320 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ATP8B2P98198 1209 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SEMG2Q02383 582 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PTPAQ15257 358 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 DGKKQ5KSL6 1271 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SYDE2Q5VT97 1194 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 VPS45Q9NRW7 570 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ADA2Q9NZK5 511 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 WDR35Q9P2L0 1181 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 DYTNA2CJ06 578 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 HIST1H2ABP04908 130 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MUM1Q2TAK8 710 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 OGFOD2Q6N063 350 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KCNB2Q92953 911 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 NUP58Q9BVL2 599 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 GOLGA8RI6L899 631 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 RASGRF2O14827 1237 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 MTMR2Q13614 643 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 WNK4Q96J92 1243 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 SLITRK1Q96PX8 696 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 TRPV6Q9H1D0 765 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 RNF146Q9NTX7 359 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 VSTM5A8MXK1 200 aa5.47□□□□□ -1.53
ZBED6-202ENST00000550078 KLRF2D3W0D1 207 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms