RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233190.10

NDUFS1-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS1, Length 11,819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-201ENST00000233190 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MAPKBP1O60336 1514 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MED23Q9ULK4 1368 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CRKP46108 304 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 HEXAP06865 529 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PPP2R1BP30154 601 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 IL9RQ01113 521 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CCDC185Q8N715 623 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 UBE4BO95155 1302 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CABYRO75952 493 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PANX2Q96RD6 677 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 LDAHQ9H6V9 325 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GRK4P32298 578 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 COG2Q14746 738 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FRMD6Q96NE9 622 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CYTH3O43739 400 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 AP1S2P56377 157 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ALS2CLQ60I27 953 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FESP07332 822 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 STILQ15468 1287 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 HDXQ7Z353 690 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ADSSL1Q8N142 457 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NELFBQ8WX92 580 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 VPS16Q9H269 839 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CHST12Q9NRB3 414 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ING3Q9NXR8 418 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PEX12O00623 359 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 USP4Q13107 963 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ADAM9Q13443 819 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NAA35Q5VZE5 725 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ZFATQ9P243 1243 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PLXNC1O60486 1568 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 HEATR9A2RTY3 570 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 F5H5T6 163 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CASKO14936 926 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PJA2O43164 708 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CYB5AP00167 134 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CYP17A1P05093 508 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NOS3P29474 1203 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PPM1AP35813 382 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CHRNDQ07001 517 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 STAT4Q14765 748 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.261e-6■■□□□ 13.6
NDUFS1-201ENST00000233190 GPR135Q8IZ08 494 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NEK7Q8TDX7 302 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 LPAR1Q92633 364 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 USP7Q93009 1102 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FAF2Q96CS3 445 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NENFQ9UMX5 172 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GDF11O95390 407 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FGRP09769 529 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 XRCC4Q13426 336 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 LIX1Q8N485 282 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 UGGT2Q9NYU1 1516 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CAPN14A8MX76 684 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 BUB1O43683 1085 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PFKFB2O60825 505 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FGFR1P11362 822 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MAP2K5Q13163 448 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 RAB30Q15771 203 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 RASSF3Q86WH2 238 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PIGBQ92521 554 aa7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms