RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAP1Q03518 808 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNIP3Q96KP6 325 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLC4Q9NSK0 619 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DFFAO00273 331 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAC1P20366 129 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR6J1Q8NGC5 347 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP33Q8TEY7 942 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 58.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC138Q96M89 665 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STOML1Q9UBI4 398 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BRJ5 948 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATF7IP2Q5U623 682 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB12Q6NXP0 572 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTMR8Q96EF0 704 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT43Q96FT9 208 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSTA4O15217 222 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAP2P40123 477 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOX10P56693 466 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYTH3O43739 400 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SREBF1P36956 1147 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEA4P43358 317 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MORF4L2Q15014 288 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACAD11Q709F0 780 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PARP9Q8IXQ6 854 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUN2Q9UH99 717 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5HO75947 161 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAXCQ5TGI0 409 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGS9BPQ6ZS82 235 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF2BQ8N4N8 673 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT82Q9NSB4 513 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADA2Q9NZK5 511 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF3C4Q9UKN8 822 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAD23BP54727 409 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF560Q96MR9 790 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC39CQ8N584 583 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAS1R2Q8TE23 839 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCMT1Q9UIC8 334 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BTBD8Q5XKL5 378 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC26A7Q8TE54 656 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKEF1Q9NU02 776 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ESRRGP62508 458 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COBLL1Q53SF7 1204 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FSCBQ5H9T9 825 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO25Q8TCJ0 367 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERP27Q96DN0 273 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEC16BQ96JE7 1060 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HACL1Q9UJ83 578 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP20Q9Y2K6 914 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ICAM1P05362 532 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COILP38432 576 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPTX2P47972 431 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLRA4Q5JXX5 417 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASSF3Q86WH2 238 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC20A1Q8WUM9 679 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR35Q9P2L0 1181 aa17.43■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPI1P60174 286 aa17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL17RAQ96F46 866 aa17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM8A1Q9UBU6 413 aa17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXTL3O43909 919 aa17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPB1P15086 417 aa17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SARSP49591 514 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK17Q00537 523 aa17.42■□□□□ 0.38
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