RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 JADE1Q6IE81 842 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM173BQ6P4H8 233 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD28-203ENST00000439830 DSTYKQ6XUX3 929 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD28-203ENST00000439830 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
ANKRD28-203ENST00000439830 BEST2Q8NFU1 509 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD28-203ENST00000439830 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ANKRD28-203ENST00000439830 SIT1Q9Y3P8 196 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD28-203ENST00000439830 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF197O14709 1029 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ECI2O75521 394 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 STARD6P59095 220 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 SLFN12LQ6IEE8 588 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 IQCEQ6IPM2 695 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 DYMQ7RTS9 669 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 SFR1Q86XK3 245 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 HVCN1Q96D96 273 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 NFICP08651 508 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 TWF1Q12792 350 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM132DQ14C87 1099 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 CYP4A22Q5TCH4 519 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ADALQ6DHV7 355 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 FRMD5Q7Z6J6 570 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PJA1Q8NG27 643 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 CLIC6Q96NY7 704 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 FOXQ1Q9C009 403 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 SEL1LQ9UBV2 794 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 DERAQ9Y315 318 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 OR6C75A6NL08 312 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 TISP43B9A030 160 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD63C9JTQ0 380 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PPEF2O14830 753 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 MICAL2O94851 1124 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 DCNP07585 359 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 TYMPP19971 482 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PAX3P23760 479 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ACOT2P49753 483 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PRKCQQ04759 706 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF720Q7Z2F6 126 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 LEMD2Q8NC56 503 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 TCEAL4Q96EI5 215 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ASB7Q9H672 318 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 STYXL1Q9Y6J8 313 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 F5P12259 2224 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PRR23AA6NEV1 266 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 OR4Q2P0C623 313 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ODC1P11926 461 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 LILRA4P59901 499 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 OVOS1Q6IE37 1185 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 SV2BQ7L1I2 683 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ASAH2Q9NR71 780 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 CEP72Q9P209 647 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 MTMR6Q9Y217 621 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 YIPF1Q9Y548 306 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 COL4A2P08572 1712 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PPP1R37O75864 691 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 GAP43P17677 238 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 CCR2P41597 374 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PLD1Q13393 1074 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC44A4Q53GD3 710 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 C9orf57Q5W0N0 161 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 POTEHQ6S545 545 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ASCL5Q7RTU5 278 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ELSPBP1Q96BH3 223 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 SENP8Q96LD8 212 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 PGLYRP2Q96PD5 576 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 USP28Q96RU2 1077 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 BACH2Q9BYV9 841 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 C2CD2Q9Y426 696 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 SPTBN4Q9H254 2564 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 KANSL1LA0AUZ9 987 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 MYMKA6NI61 221 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 MYBPC2Q14324 1141 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 POMGNT1Q8WZA1 660 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ANKRD28-203ENST00000439830 DENND4CQ5VZ89 1909 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD28-203ENST00000439830 PIRO00625 290 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD28-203ENST00000439830 VNN2O95498 520 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD28-203ENST00000439830 MYL4P12829 197 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD28-203ENST00000439830 FCARP24071 287 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD28-203ENST00000439830 STAT6P42226 847 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD28-203ENST00000439830 EPHA5P54756 1037 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD28-203ENST00000439830 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
ANKRD28-203ENST00000439830 GPR17Q13304 367 aa27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms