RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452157.5

MIER3-208, Transcript of MIER family member 3, human

TSL 1 (best)

Gene MIER3, Length 5,240 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIER3-208	ENST00000452157	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	CBX1	P83916	185 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	CETN2	P41208	172 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	NUCB2	P80303	420 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	KIF5C	O60282	957 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	STMN1	P16949	149 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	PLEKHG5	O94827	1062 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	POTEJ	P0CG39	1038 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	ANAPC15	P60006	121 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	XBP1	P17861	261 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MIER3-208	ENST00000452157	ERICH2	A1L162	156 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	CNGA1	P29973	690 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	FOXD1	Q16676	465 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	DDX12P	Q92771	950 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	CPLX1	O14810	134 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MIER3-208	ENST00000452157	ERC2	O15083	957 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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