RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 MAGEA4P43358 317 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 RCN2Q14257 317 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 C17orf75Q9HAS0 396 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PARVGQ9HBI0 331 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L15C9J2P7 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L11C9JVI0 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L18D6R9N7 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L22D6RA61 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L19D6RCP7 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L20D6RJB6 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 SPOPO43791 374 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 MAPTP10636 758 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L24Q0WX57 530 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PPP2R5CQ13362 524 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 RASA3Q14644 834 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 USP17L6PQ6QN14 398 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 KREMEN1Q96MU8 473 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PWWP2AQ96N64 755 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 KCNK13Q9HB14 408 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 POLIQ9UNA4 740 aa10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PIK3CDO00329 1044 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 MAGEC1O60732 1142 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 CRABP2P29373 138 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PPP3CAQ08209 521 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 MAPK6Q16659 721 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 EFHC2Q5JST6 749 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 IZUMO3Q5VZ72 239 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ACAD10Q6JQN1 1059 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 OGFOD1Q8N543 542 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 CCDC89Q8N998 374 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 TBK1Q9UHD2 729 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GVG6 124 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 H0Y3Z8 333 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 DHRS4L1P0CG22 281 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 CNPY1Q3B7I2 92 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ZNF449Q6P9G9 518 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 STKLD1Q8NE28 680 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ATG4AQ8WYN0 398 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 EMSYQ7Z589 1322 aa10.49□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 FAM196BA6NMK8 535 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 FAM13AO94988 1023 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 RARBP10826 455 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 DLG4P78352 724 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 RINLQ6ZS11 566 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 BTG4Q9NY30 223 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 TM9SF1O15321 606 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PSTPIP1O43586 416 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 SPAG7O75391 227 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 FAM155BO75949 473 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 SLITRK3O94933 977 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 LYNP07948 512 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 FDX1P10109 184 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 SHMT1P34896 483 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 RPL26P61254 145 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 LSAMPQ13449 338 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 GRM2Q14416 872 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 B3GNT9Q6UX72 402 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 CHSY1Q86X52 802 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHO2Q8TD55 490 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 DCAF4Q8WV16 495 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 MKL1Q969V6 931 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 ZNF653Q96CK0 615 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 NSL1Q96IY1 281 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 PLA2G4CQ9UP65 541 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 COQ4Q9Y3A0 265 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 NRXN2Q9P2S2 1712 aa10.48□□□□□ -0.73
HCG18-242ENST00000602319 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms