RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.33□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.33□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 TECTAO75443 2155 aa4.33□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 A0A1B0GVL5 298 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 FSD2A1L4K1 749 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SHISA7A6NL88 538 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANHXE9PGG2 379 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYN3O14994 580 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCL16O15467 120 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 HCRTO43612 131 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 TBCAO75347 108 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 MOSPD3O75425 235 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SOAT2O75908 522 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 OAZ2O95190 189 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 GCNT3O95395 438 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 C8AP07357 584 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 OR4Q2P0C623 313 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLFN14P0C7P3 912 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ALADP13716 330 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PFKFB1P16118 471 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 NPR3P17342 541 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 GAP43P17677 238 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 GARTP22102 1010 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CMA1P23946 247 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 AFMP43652 599 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ME1P48163 572 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 NDUFA8P51970 172 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ROR1Q01973 937 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 STK4Q13043 487 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PTPN21Q16825 1174 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC142Q17RM4 750 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 WSCD1Q658N2 575 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CES5AQ6NT32 575 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PARM1Q6UWI2 310 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM67Q6ZTA4 783 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 UNC13DQ70J99 1090 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CBWD2Q8IUF1 395 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC44A3Q8N4M1 653 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTC9BQ8N6N2 239 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 IQUBQ8NA54 791 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 BEST2Q8NFU1 509 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 OR5B17Q8NGF7 314 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF516Q92618 1163 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 TCEAL4Q96EI5 215 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PAGE5Q96GU1 130 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SENP8Q96LD8 212 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 ACCSQ96QU6 501 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM213AQ9BRX8 229 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 LRRC3Q9BY71 257 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 DNAJC25Q9H1X3 360 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 TNMDQ9H2S6 317 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CUEDC2Q9H467 287 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNK12Q9HB15 430 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 DMAC2Q9NW81 257 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CEP72Q9P209 647 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 USTQ9Y2C2 406 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 NME7Q9Y5B8 376 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.32□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 DMDP11532 3685 aa4.31□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 NCANO14594 1321 aa4.31□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 CLUHO75153 1309 aa4.31□□□□□ -1.72
UBE2Q1-204ENST00000476612 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.6 ms