RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 MTFR1LQ9H019 292 aa13.08□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 CARD9Q9H257 536 aa13.08□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM206Q9H813 350 aa13.08□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.08□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.08□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.08□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.08□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RTN2O75298 545 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 PRLRP16471 622 aa13.07□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 AGBL2Q5U5Z8 902 aa13.07□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 ATL2Q8NHH9 583 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAJC9Q8WXX5 260 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RIPK2O43353 540 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 CST8O60676 142 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 SUPT3HO75486 399 aa13.07□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 EDRF1Q3B7T1 1238 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa13.07□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 FAM20AQ96MK3 541 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 HSPA6P17066 643 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF135Q8IUD6 432 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 PRELID2Q8N945 189 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM39BQ9GZU3 492 aa13.07□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RHBDL2Q9NX52 303 aa13.07□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 STOML1Q9UBI4 398 aa13.07□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 BBOX1O75936 387 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RFC5P40937 340 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 CDH6P55285 790 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 OLFML2BQ68BL8 750 aa13.06□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 NLRP9Q7RTR0 991 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 NUDCD3Q8IVD9 361 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 CCNYL1Q8N7R7 359 aa13.06□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 ACTRT1Q8TDG2 376 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 KCNH7Q9NS40 1196 aa13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 TECPR2O15040 1411 aa13.06□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 PARD3BQ8TEW8 1205 aa13.06□□□□□ -0.32
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TRIOBP-211ENST00000492485 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 TJP3O95049 919 aa13.05□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 ARSHQ5FYA8 562 aa13.05□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 PCNX4Q63HM2 1172 aa13.05□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 EXOC3L1Q86VI1 746 aa13.05□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RASSF3Q86WH2 238 aa13.05□□□□□ -0.32
TRIOBP-211ENST00000492485 RHOT1Q8IXI2 618 aa13.05□□□□□ -0.32
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